Bupati Mukomuko adalah kepala daerah tingkat II yang memegang pemerintahan di Mukomuko bersama dengan Wakil Bupati dan 25 anggota Dewan Perwakilan Rakyat Daerah Kabupaten Mukomuko. Bupati dan Wakil Bupati Mukomuko dipilih melalui pemilihan umum yang dilaksanakan 5 tahun sekali. Bupati Mukomuko saat ini adalah Sapuan.
^Peresmian pembentukan Kabupaten Mukomuko sekaligus melantik Amandeka Amir sebagai Pj. Bupati Mukomuko.
^Bupati Mukomuko cuti selama 71 hari dalam kontestasi Pemilihan umum Bupati Mukomuko 2020. Kemudian, Gubernur Bengkulu menunjuk Wakil Bupati Mukomuko untuk menjadi Penjabat Sementara Bupati Mukomuko.[7]