Đề án số S35B. Năm chiếc được lên kế hoạch chế tạo trong Chương trình Maru Tsui năm 1941 (các chiếc số 620 - 621) và Chương trình Kai-Maru 5 năm 1942 (các chiếc số 5091 - 5093). Chúng trang bị động cơ diesel công suất yếu hơn nhằm rút ngắn thời gian đóng tàu. Chỉ có một chiếc I-12 được hoàn tất theo thiết kế ban đầu; I-13 và những chiếc tiếp theo được cải biến sang một lớp tàu mới (lớp I-13), sau khi số lượng tàu lớp I-400 Sen Toku bị cắt giảm.
Yokosuka, 29 tháng 8, 1945. Từ trái sang phải: USS Proteus, I-400, I-401 và I-14
Đề án số S35C. Bốn chiếc nguyên thuộc Type A Cải tiến 1 (lớp I-12) được cải biến sang một lớp tàu mới (lớp I-13), sau khi số lượng tàu lớp I-400 Sen Toku bị cắt giảm. Chúng có hầm chứa máy bay lớn và những khoang hai bên để vận hành hai thủy phi cơ cường kích Aichi M6A1 Seiran. Những thiết bị trong vai trò soái hạm bị tháo dỡ. Chỉ có hai chiếc kịp hoàn tất và nhập biên chế.
Bị tàu khu trục USS Murray bắt giữ, 27 tháng 8, 1945; xuất biên chế, 15 tháng 9, 1945; đánh chìm như mục tiêu tại quần đảo Hawaii, 28 tháng 5, 1946.
5092
I-15
Xưởng tàu Kawasaki-Senshū Xưởng tàu Kawasaki-Kōbe (sau khi hạ thủy)
30 tháng 4, 1943
12 tháng 4, 1944
Cải biến thành tàu ngầm chở dầu, tháng 6, 1945;[1] Hoàn tất được 90%; tháo dỡ năm 1945.
5093
I-1
Xưởng tàu Kawasaki-Kōbe Xưởng tàu Kawasaki-Senshū (sau khi hạ thủy)
24 tháng 6, 1943
10 tháng 6, 1944
Hoàn tất được 70%; đắm trong một cơn bão, 18 tháng 9, 1945; trục vớt và tháo dỡ sau đó
Type V21
Đề án số S48. Ba chiếc được lên kế hoạch chế tạo trong Chương trình Kai-Maru 5 năm 1942 (các chiếc số 5094 - 5096). Tuy nhiên tất cả đều bị hủy bỏ vào cuối năm 1943 khi Hải quân Đế quốc Nhật Bản dự định chuyển trọng tâm sang chế tạo Type E (lớp tàu ngầm) [ja] (戊型潜水艦,Bo-gata sensuikan?) như là tàu ngầm chủ lực cho năm 1945.
Rekishi Gunzō, History of Pacific War Vol.63 "Documents of IJN submarines and USN submarines", Gakken (Japan), January 2008, ISBN978-4-05-605004-2
Rekishi Gunzō, History of Pacific War Extra, "Perfect guide, The submarines of the Imperial Japanese Forces", Gakken (Japan), March 2005, ISBN4-05-603890-2
Model Art Extra No.537, Drawings of Imperial Japanese Naval Vessels Part-3, Model Art Co. Ltd. (Japan), May 1999, Book code 08734-5
The Maru Special, Japanese Naval Vessels No.13, "Japanese submarines I-13 class and I-400 class", Ushio Shobō (Japan), July 1977, Book code 8343-7
The Maru Special, Japanese Naval Vessels No.31, "Japanese Submarines I", Ushio Shobō (Japan), September 1979, Book code 68343-31
Senshi Sōsho Vol.88 Naval armaments and war preparation (2), "And after the outbreak of war", Asagumo Simbun (Japan), October 1975
Chú thích: D - Chiếc duy nhất trong lớp • C - Kiểu tàu được cải biến • N - Xếp lớp tàu tuần dương hạng nhẹ theo Hiệp ước hải quân Washington cho đến năm 1939 • H - Chưa hoàn tất vào lúc chiến tranh kết thúc