Ce gaucher talentueux originaire du Caire s'est montré très prometteur lorsqu'il termine finaliste (face à son compatriote Ahmed Faizy) du British Junior Open Under-14 en janvier 1993. Quatre ans plus tard, il atteint la finale de l'Open britannique des moins de 19 ans, où il s'incline à nouveau face à Faizy.
Membre de la PSA depuis 1995, Amr Shabana remporte son premier titre sur le circuit en juillet 1999, en gagnant l'Open de Puebla au Mexique. Sept jours plus tard, il remporte son deuxième titre, l'Open de Mexico, en battant l'Australien Craig Rowland en finale.
Amr Shabana couronne une année remarquable en 2003 lorsque, en tant que tête de série numéro 9, il se fraye un chemin rempli de stars lors des championnats du monde au Pakistan. Il élimine le tenant du titre, David Palmer, tête de série numéro 3, en cinq jeux au troisième tour. Il élimine ensuite le coéquipier australien de Palmer, Anthony Ricketts, en huitième de finale. Après avoir battu Karim Darwish (le numéro 1 égyptien) en quatre jeux en demi-finale, Amr Shabana remporte le titre historique en battant Thierry Lincou en finale 15-14, 9-15, 15-11, 15-7, devenant ainsi le premier Égyptien à remporter le titre suprême du squash.
Mais après une année suivante décevante, au cours de laquelle sa seule apparition en finale a été le British Open en Angleterre, où il perd contre David Palmer en quatre jeux 10-11 (4-6), 11-7, 11-10 (3-1), 11-7, Amr Shabana revient au sommet de son art en 2005. En peu de temps, il enrôle un nouvel entraîneur, Ahmed Tahir et un nouveau manager, l'ancien international égyptien Omar Elborolossy. Une semaine après avoir remporté l'Heliopolis Open dans sa ville natale du Caire, Amr Shabana, tête de série numéro 7, bat David Palmer et James Willstrop, avant de battre Anthony Ricketts en finale pour remporter le St Louis Open aux États-Unis.
L'événement suivant voit l'Égyptien en forme balayer toute opposition à l'Open de Hongrie à Budapest, remportant son troisième titre en autant de semaines après avoir battu Grégory Gaultier en finale. Mais le championnat du monde à Hong Kong confirme sa renaissance sans aucun doute. Tête de série n°5, il écrase Lee Beachill, tête de série numéro 4, en quart de finale, Peter Nicol en demi-finale et, pour sa troisième victoire consécutive, il bat David Palmer 11-6 11-7 11-8 en finale pour devenir le premier joueur depuis l'apogée des Khans à remporter le titre de champion du monde pour une deuxième fois.
La nouvelle année apporte de nouvelles récompenses à Shabana avec des victoires au Canadian Classic en janvier, suivies du Tournoi des champions à New York en mars et du Masters PSA des Bermudes en avril - portant son total de titres du PSA Tour à 12, puis en avril 2006, Shabana devient le premier joueur égyptien à atteindre la place de numéro 1 mondial.
En 2007, Amr Shabana est couronné champion du monde pour la troisième fois en cinq ans aux championnats du monde aux Bermudes et plus tard, en janvier 2009, le règne de 33 mois de Shabana comme numéro 1 mondial cesse avec l’avènement de son compatriote Karim Darwish.
En 2014, Amr Shabana devient le professionnel le plus âgé à remporter un titre mondial en battant Grégory Gaultier en finale du Tournoi des champions.
Le 27 août 2015, Amr Shabana annonce sa retraite du squash professionnel de compétition[1].
