Jmol

Jmol
PengembangTim pengembang Jmol
Rilis awal2001; 25 tahun lalu (2001)
Templat:Kotak info perangkat lunak/simple
Ditulis dalamJava
Sistem operasiLintas platform
PlatformSistem dengan Java dan peramban web tanpa Java
Tersedia dalam16 bahasa
Daftar bahasa
Katalan, Tionghoa, Ceko, Denmark, Belanda, Inggris, Prancis, Jerman, Hungaria, Indonesia, Italia, Korea, Portugis, Spanyol, Turki, Ukraina[1]
JenisPemodelan molekul
LisensiLGPL 2.0
Situs webwww.jmol.org
Repositorisourceforge.net/projects/jmol

Jmol adalah perangkat lunak komputer bagi pemodelan molekul struktur kimia dalam 3-dimensi.[2] Jmol menampilkan representasi 3D dari molekul yang dapat digunakan sebagai alat pengajaran,[3] atau untuk penelitian seperti, dalam kimia dan biokimia. Perangkat lunak ini ditulis dalam bahasa pemrograman Java, sehingga dapat beroperasi pada sistem operasi Windows, macOS, Linux, serta Unix, jika Java telah terpasang. Perangkat ini bersifat bebas dan bersumber-terbuka yang dirilis di bawah GNU Lesser General Public License (LGPL) versi 2.0. Terdapat aplikasi mandiri dan perangkat lunak pengembangan (SDK) yang dapat diintegrasikan ke dalam aplikasi Java lainnya, seperti Bioclipse dan Taverna.

Fitur yang populer adalah applet yang dapat diintegrasikan ke dalam halaman web untuk menampilkan molekul dalam berbagai cara. Misalnya, molekul dapat ditampilkan sebagai model bola-dan-pasak, model ruang terisi, diagram pita, dan lain sebagainya.[4] Jmol mendukung berbagaii format berkas kimia, termasuk Protein Data Bank (pdb), Crystallographic Information File (cif), MDL Molfile (mol), dan Chemical Markup Language (CML). Terdapat pula versi hanya-JavaScript (HTML5), JSmol, yang dapat digunakan pada komputer yang tidak memiliki Java.[5]

Applet Jmol, di samping kemampuan lainnya, menyediakan alternatif bagi plug-in Chime,[3] yang tidak lagi dikembangkan. Sementara Jmol memiliki banyak fitur yang tidak dimiliki Chime, perangkat lunak ini tidak mengklaim untuk mereproduksi semua fungsi Chime, terutama, mode Sculpt. Chime membutuhkan instalasi plug-in dan Internet Explorer 6.0 atau Firefox 2.0 pada Microsoft Windows, atau Netscape Communicator 4.8 pada Mac OS 9. Jmol membutuhkan instalasi Java dan beroperasi pada berbagai platform. Misalnya, Jmol berfungsi penuh di Mozilla Firefox, Internet Explorer, Opera, Google Chrome, dan Safari.


Tangkapan layar

  • Struktur kristal dari kotak H/ACA RNP dari Pyrococcus furiosus.
    Struktur kristal dari kotak H/ACA RNP dari Pyrococcus furiosus.
  • Menyorot dua jembatan garam pada tetramer hemoglobin (gugus hemo sebagai pasak di kanan bawah).
    Menyorot dua jembatan garam pada tetramer hemoglobin (gugus hemo sebagai pasak di kanan bawah).
  • Suatu fragmen faktor transkripsi TFIIIA membentuk tiga motif jari seng berurutan, terikat pada bentangan DNA.
    Suatu fragmen faktor transkripsi TFIIIA membentuk tiga motif jari seng berurutan, terikat pada bentangan DNA.
  • Ribosom 70S Eubakteria dari Thermus thermophilus.
    Ribosom 70S Eubakteria dari Thermus thermophilus.

Lihat pula

Referensi

  1. ^ "Translations : Jmol". translations.launchpad.net.
  2. ^ Chen, Jim X. (2008), Springer (ed.), Guide to Graphics Software Tools (dalam bahasa Inggris), hlm. 471, ISBN 978-1-84800-900-4
  3. ^ a b Herráez, A (2006), "Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue", Biochemistry and Molecular Biology Education (dalam bahasa Inggris), 34 (4): 7, doi:10.1002/bmb.2006.494034042644
  4. ^ Herráez, A (2007), Lulu (ed.), How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1, hlm. 21, ISBN 978-1-84799-259-8
  5. ^ "JSmol" (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 2 November 2015.

Pranala luar

Wikimedia Commons memiliki media mengenai Jmol.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.