William Esco (W. E.) Moerner (lahir 24 Juni 1953) adalah seorang ahli kimia & biofisika dan profesor di Stanford University warga negara Amerika Serikat yang mendapat hadiah Nobel untuk bidang kimia tahun 2014 bersama Stefan W. Hell dan Eric Betzig untuk hasil karya mereka dalam mengembangkan mikroskopi floresen (super-resolved fluorescence microscopy).
