Barcode of Life Data System

Barcode of Life Data System (umumnya dikenal sebagai BOLD atau BOLDSystems) adalah platform web yang secara khusus ditujukan untuk barcode DNA.[1][2] BOLD adalah platform penyimpanan dan analisis data berbasis cloud yang dikembangkan di Center for Biodiversity Genomics di Kanada. BOLD terdiri dari empat modul utama, portal data, portal pendidikan, registri BIN (spesies terduga), dan meja kerja pengumpulan dan analisis data yang menyediakan platform online untuk menganalisis urutan DNA.[2] Sejak diluncurkan pada tahun 2005, BOLD telah diperluas untuk menyediakan berbagai fungsi termasuk organisasi data, validasi, visualisasi, dan publikasi. Versi sistem terbaru, versi 4, diluncurkan pada tahun 2017, menghadirkan serangkaian peningkatan yang mendukung pengumpulan dan analisis data, tetapi juga mencakup fungsionalitas baru yang meningkatkan penyebaran, kutipan, dan anotasi data.[3] Sebelum 16 November 2020, BOLD sudah berisi urutan barcode untuk 318.105 spesies yang dideskripsikan secara formal meliputi hewan, tumbuhan, jamur, protista (dengan ~8,9 juta spesimen).[4]

BOLD tersedia secara gratis untuk setiap peneliti yang tertarik dengan DNA Barcoding. Dengan menyediakan layanan khusus, BOLD membantu publikasi catatan yang memenuhi standar yang diperlukan untuk mendapatkan penandaan BARCODE dalam database sekuens nukleotida internasional. Karena pengiriman berbasis web dan model keamanan data yang fleksibel, BOLD juga diposisikan dengan baik untuk mendukung proyek yang melibatkan aliansi penelitian yang luas.[3]

Rilis data BOLD terutama berasal dari proyek BARCODE 500K[5] yang dilaksanakan oleh International Barcode of Life (iBOL) Consortium dari tahun 2010 hingga 2015. Proyek ini bertujuan untuk akuisisi data catatan barcode DNA untuk 5 juta spesimen yang mewakili 500 ribu spesies. Semua koleksi spesimen, penempatan urutan, pemilahan informasi disumbangkan oleh sejumlah besar ilmuwan, kolaborator, dan fasilitas dari negara-negara di seluruh dunia. Akumulasi data meningkatkan akurasi identifikasi barcode DNA dan memfasilitasi pencapaian penandaan barcode setiap kehidupan.

Referensi

  1. ^ Ratnasingham, Sujeevan; Hebert, Paul D. N. (2013). "A DNA-Based Registry for All Animal Species: The Barcode Index Number (BIN) System". PLOS ONE. 8 (7): e66213. Bibcode:2013PLoSO...866213R. doi:10.1371/journal.pone.0066213. ISSN 1932-6203. PMC 3704603 alt=Dapat diakses gratis. PMID 23861743. 
  2. ^ a b RATNASINGHAM, SUJEEVAN; HEBERT, PAUL D. N. (2007-01-24). "BARCODING: bold: The Barcode of Life Data System (http://www.barcodinglife.org)". Molecular Ecology Notes. 7 (3): 355–364. doi:10.1111/j.1471-8286.2007.01678.x. ISSN 1471-8278. PMC 1890991 alt=Dapat diakses gratis. PMID 18784790. 
  3. ^ a b "BOLD Print Handbook for BOLD v4". www.boldsystems.org. Diakses tanggal 2020-11-16. 
  4. ^ "Kingdoms of Life Being Barcoded | BOLDSYSTEMS". www.boldsystems.org. Diakses tanggal 2020-11-16. 
  5. ^ "BARCODE 500K". ibol.org. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2021-08-16. Diakses tanggal 2023-05-04. 

Pranala luar

Templat:Bioinformatics

Kembali kehalaman sebelumnya