Kotak Pribnow

Kotak Pribnow, disebut juga kotak Pribnow-Schaller, adalah sebuah sekuens TATAAT yang terdiri dari enam nukleotida. Sekuens ini merupakan bagian penting dari situs promotor di DNA untuk proses transkripsi bakteri.^[1][2] Kotak Pribnow termasuk sekuens konsensus—yakni basa yang paling sering muncul di setiap posisi dalam banyak promotor; tiap promotor bisa saja memiliki variasi perbedaan dari konsensus pada satu atau lebih posisi. Sekuens ini sering pula disebut sekuens -10 atau elemen karena terletak sekitar sepuluh pasang basa di hulu dari situs inisiasi transkripsi.^[3]

Kotak Pribnow memiliki fungsi yang mirip dengan kotak TATA, bahkan urutan nukleotidanya sangat mirip. Sekuens ini diidentifikasi dan menempel dengan subunit RNA polimerase saat inisiasi proses transkripsi.^[4] Bagian DNA ini juga merupakan tempat pertama pasang basa terbuka selama transkripsi prokariota untuk membuka akses ke untai template. Kandungan AT yang tinggi diperlukan untuk memungkinkan pemisahan, sebab adenina dan timina lebih mudah dipisahkan (akibat ikatan hidrogen yang lebih rendah serta efek base stacking yang lebih lemah).^[5]

Sekuens ini dinamakan berdasarkan nama penemunya, yakni David Pribnow dan Heinz Schaller.^[6]

• Kotak TATA

1. ^ Pribnow, David (March 1975). "Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site at an early T7 promoter". PNAS. 72 (3): 784–788. Bibcode:1975PNAS...72..784P. doi:10.1073/pnas.72.3.784 . ISSN 1091-6490. PMC 432404 . PMID 1093168. 
2. ^ Schaller, Heinz; Gray, Christopher; Herrman, Karin (February 1975). "Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site from the DNA of Bacteriophage fd". PNAS. 72 (2): 737–741. Bibcode:1975PNAS...72..737S. doi:10.1073/pnas.72.2.737 . ISSN 1091-6490. PMC 432391 . PMID 1054851. 
3. ^ Madigan, Michael T.; Bender, Kelly S.; Buckley, Daniel H.; Sattley, W. Matthew; Stahl, David A.; Brock, Thomas D. (2019). Brock biology of microorganisms (edisi ke-Fifteenth edition, global edition). NY, NY: Pearson. ISBN 978-1-292-23510-3. Pemeliharaan CS1: Teks tambahan (link)
4. ^ Feklistov, Andrey; Darst, Seth (2011). "Structural Basis for Promoter −10 Element Recognition by the Bacterial RNA Polymerase σ Subunit". Cell. 147 (6): 1257–69. doi:10.1016/j.cell.2011.10.041. PMC 3245737 . PMID 22136875. 
5. ^ Yakovchuk, Peter; Protozanova, Ekaterina; Frank-Kamenetskii, Maxim D. (January 2006). "Base-stacking and base-pairing contributions into thermal stability of the DNA double helix". Nucleic Acids Research. 34 (2): 564–574. doi:10.1093/nar/gkj454. ISSN 0305-1048. PMC 1360284 . PMID 16449200. 
6. ^ "Pribnow_box". www.chemeurope.com. Diakses tanggal 2024-04-07.